Программа предусматривает реализацию мероприятий по девяти направлениям:
I. Правовое обеспечение мероприятий по профилактике и борьбе со СПИДом;
II. Развитие системы информирования населения;
III. Совершенствование эпидемиологического надзора за распространением ВИЧ-инфекции и вирусных гепатитов В и С и государственного контроля за проведением профилактических и противоэпидемических мероприятий;
IV. Обеспечение безопасности медицинских манипуляций, донорской крови, медицинских иммунобиологических препаратов, биологических жидкостей, органов и тканей;
V. Совершенствование диагностики и лечения ВИЧ-инфекции, вирусных гепатитов В и С;
VI. Подготовка кадров по вопросам диагностики, клиники, лечения, эпидемиологии и профилактики ВИЧ-инфекции и вирусных гепатитов В и С;
VII. Социальная защита ВИЧ-инфицированных, членов их семей и лиц, подвергающихся риску заражения при исполнении ими служебных обязанностей;
VIII. Научно-прикладные исследования по проблемам ВИЧ-инфекции;
IX. Профилактика ВИЧ-инфекции в местах лишения свободы.