К числу внедренных систем Комплекса относятся ИСС экономических показателей г.Москвы; АИС "Строительные инвестиции"; ИС районных налоговых инспекций; АБД Госреестра налогоплательщиков; АИС учета и регистрации налогоплательщиков; ИС лицензионной палаты; ИС Москомимущества; ИС Москомзема; ИС Москорбти.
Перечисленные системы представляют собой разрозненные подсистемы по уровням управления - центральными и районными структурами. Важным направлением развития информационной инфраструктуры Комплекса является обеспечение информационно-функционального взаимодействия его структур между собой и внешними системами (УДНП, Государственным таможенным Комитетом и др.).