Пропуск грузов для Полигона через таможенные границы Республики Казахстан и Российской Федерации осуществляется в соответствии с действующим таможенным законодательством Российской Федерации и Республики Казахстан без уплаты таможенных пошлин, акцизов и иных налогов, взимание которых возложено на таможенные органы.
Военнослужащие, члены их семей, специалисты промышленности при их направлении из Российской Федерации на Полигон и обратно провозят личное имущество через таможенную границу без уплаты таможенных пошлин, акцизов и иных налогов, взимание которых возложено на таможенные органы.
Порядок воинских перевозок и осуществления расчетов за них определяется отдельным соглашением Сторон (абзац дополнительно включен с 3 августа 2007 года Международным протоколом от 4 апреля 2006 года).