Объем ассигнований бюджета Санкт-Петербурга на финансирование отрасли "Здравоохранение" в 2009 году составил 49983,7 млн.руб., в том числе:
- средства бюджета Санкт-Петербурга - 24919,2 млн.руб.,
- средства предпринимательской и иной приносящей доход деятельности - 6626,4 млн.руб.,
- средства от страховых медицинских организаций - 17306,1 млн.руб.,
- средства федерального бюджета - 1132 млн.руб.
В 2009 году на капитальный ремонт учреждений здравоохранения, с учетом расходов администраций районов Санкт-Петербурга, направлено 448,8 млн.руб. На мероприятия по пожарной безопасности учреждений здравоохранения были выделены средства в сумме 82,4 млн.руб. На централизованное приобретение дорогостоящего медицинского оборудования по целевой статье 4690052 было запланировано 204,1 млн.руб. Кроме того, приобретение оборудования для учреждений здравоохранения осуществлялось по отдельным целевым статьям. Расходы на оказание специализированной медицинской помощи - 1339,4 млн.руб., расходы на оказание специализированной медицинской помощи при лечении бесплодия с применением вспомогательных репродуктивных технологий - 46,9 млн.руб.
С 01.01.2011 в Санкт-Петербурге будет осуществляться поэтапный перевод государственных учреждений здравоохранения Санкт-Петербурга, функционирующих в системе ОМС, на преимущественно одноканальное финансирование через систему ОМС.