1. Руководство (руководитель, первый заместитель, заместители руководителя).
2. Отдел воспроизводства лесов и ведения государственного лесного реестра.
3. Отдел охраны, защиты, использования лесов и лесного хозяйства, ведения мониторинга.
4. Отдел государственного лесного контроля и надзора, государственного пожарного надзора в лесах.
(Пункт 4 структуры в редакции постановления Правительства Республики Дагестан от 28.10.2010 N 388, НГР:RU05000201000326)
5. Бюджетно-финансовый отдел.
6. Отдел бухгалтерского учета.
7. Отдел правового обеспечения.
8. Отдел кадровой работы и организационно-технического обеспечения.