Организацию управления и контроль за реализацией мероприятий Программы осуществляет государственный заказчик - Правительство Республики Бурятия. Правительство Республики Бурятия ежегодно уточняет целевые показатели (индикаторы) и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации Программы, запрашивает министерства и ведомства, ответственные за выполнение мероприятий, о ходе их реализации.