Бюджетная реформа в Сахалинской области осуществляется в соответствии с основными положениями бюджетного и налогового законодательства Российской Федерации. В рамках реализации бюджетной реформы на территории Сахалинской области утверждена методика распределения финансовой помощи из областного бюджета, а также прозрачная процедура формирования и использования бюджетных средств. Кроме того, в Сахалинской области принят ряд нормативных актов по разграничению и передаче органам местного самоуправления отдельных государственных полномочий. Разработана и принята программа реформирования системы управления финансами Сахалинской области в 2006 - 2008 годах.