5.1. Представительство возглавляет руководитель Представительства, назначаемый и освобождаемый от должности правовым актом Администрации автономного округа.
Руководитель Представительства несёт персональную ответственность за выполнение возложенных на Представительство задач и выполнение им своих функций.
5.2. Руководитель Представительства имеет заместителя руководителя Представительства - начальника управления по осуществлению межрегионального взаимодействия, который исполняет обязанности руководителя Представительства при его временном отсутствии.
Заместитель руководителя Представительства - начальник управления по осуществлению межрегионального взаимодействия назначается на должность и освобождается от должности руководителем Представительства.
5.3. Правовые акты и документы (приказы о заключении служебных контрактов на определённый срок, служебные контракты на определённый срок, командировочные удостоверения, иные документы) по вопросам осуществления трудовых отношений с руководителем Представительства от имени представителя нанимателя подписывает руководитель аппарата Губернатора автономного округа.
5.4. Руководитель Представительства:
5.4.1. Руководит деятельностью Представительства.
5.4.2. Обеспечивает выполнение решений Администрации автономного округа, касающихся деятельности Представительства.
5.4.3. По поручению Губернатора или Администрации автономного округа представляет Губернатора или Администрацию автономного округа на совещаниях, заседаниях, симпозиумах, выставках и иных мероприятиях.
5.4.4. Вносит на утверждение Администрации автономного округа структуру и смету расходов Представительства, осуществляет приём работников Представительства.
5.4.5. Издаёт приказы в пределах своей компетенции, обязательные для исполнения сотрудниками Представительства.
5.4.6. Утверждает должностные регламенты государственных гражданских служащих, замещающих должности государственной гражданской службы в Представительстве, и должностные инструкции работников Представительства.
5.4.7. Вносит на рассмотрение Администрации автономного округа проекты нормативных правовых актов Администрации автономного округа, мероприятий, перспективных и текущих планов по вопросам, относящимся к деятельности Представительства.
5.4.8. Ежегодно представляет в Администрацию автономного округа отчёт и необходимую документацию о деятельности Представительства.
5.4.9. Представляет в Администрацию автономного округа и исполнительные органы государственной власти автономного округа информацию об экономике, состоянии рынка и по иным представляющим интерес вопросам.
5.4.10. Распоряжается денежными средствами в пределах утверждённых ассигнований по смете доходов и расходов Представительства на очередной финансовый год.
5.4.11. Осуществляет иные полномочия, возложенные на него Губернатором и Администрацией автономного округа.