Сельское хозяйство является одним из потенциальных факторов конкурентоспособности Республики Алтай по сравнению с другими регионами Российской Федерации. Традиционно доля сельского хозяйства в валовом региональном продукте республики превышала доли остальных отраслей. Несмотря на то, что в последнее время динамика развития сельского хозяйства отставала от динамики роста валового регионального продукта, сельское хозяйство было и остается основным видом деятельности, производящим товары.
По вкладу сельского хозяйства в валовый региональный продукт Республика Алтай занимает второе место среди регионов Сибирского федерального округа, уступая лишь Алтайскому краю. Сельское хозяйство приобретает большое значение в районах, где не предусмотрена реализация крупных туристских проектов, например, Кош-Агачском, Усть-Канском, Онгудайском.
Такие территории должны обеспечить формирование и развитие кластера готовой и качественной продукции, а также выступать поддерживающей отраслью для функционирования туристского кластера.