Исполнение республиканского бюджета и бюджета территориального государственного внебюджетного фонда Карачаево-Черкесской Республики обеспечивается Правительством Карачаево-Черкесской Республики.
Организация исполнения республиканского бюджета возлагается на Министерство финансов арачаево-Черкесской Республики и орган управления территориальным государственным внебюджетным фондом. Исполнение бюджета организуется на основе сводной бюджетной росписи и кассового плана.
Бюджет исполняется на основе единства кассы и подведомственности расходов.
По соглашению с Правительством Карачаево-Черкесской Республики полномочия Федерального казначейства по кассовому обслуживанию исполнения республиканского бюджета могут быть переданы исполнительным органам государственной власти Карачаево-Черкесской Республики при условии финансового обеспечения указанных полномочий за счет собственных доходов бюджета Карачаево-Черкесской Республики и наличия в собственности (пользовании, управлении) Карачаево-Черкесской Республики необходимого для их осуществления имущества.
Соглашение по кассовому обслуживанию исполнения республиканского бюджета Карачаево-Черкесской Республики между Правительством Карачаево-Черкесской Республики и Федеральным казначейством должно содержать положение о предоставлении информации по запросам Контрольно-счетной палаты Карачаево-Черкесской Республики в части кассового исполнения республиканского бюджета Карачаево-Черкесской Республики , бюджета территориального государственного внебюджетного фонда и бюджетов муниципальных образований, расположенных на территории Карачаево-Черкесской Республики.