Охранная зона памятника природы озера Иткуль расположена на территориях Верхнеуфалейского городского округа и Снежинского городского округа.
Граница охранной зоны памятника природы озера Иткуль определена расстоянием от границы памятника природы озера Иткуль не менее 100 м и колеблется от 100 до 2625 м. Общая протяженность границы охранной зоны памятника природы озера Иткуль составляет 31,04 км.
Площадь охранной зоны памятника природы озера Иткуль составляет 2530,15 га, в том числе на территории Верхнеуфалейского городского округа - 1799,75 га, на территории Снежинского городского округа - 730,4 га.