Департамент в соответствии с возложенными задачами обладает следующими основными полномочиями:
4.1. Осуществляемыми за счет средств республиканского бюджета:
1) владение, пользование, распоряжение водными объектами, находящимися в собственности Республики Саха (Якутия);
2) участие в разработке ставок платы за пользование водными объектами, находящимися в собственности Республики Саха (Якутия), порядка расчета и взимания такой платы;
3) участие в деятельности бассейновых советов;
4) участие в разработке и реализации программ Республики Саха (Якутия) по использованию и охране водных объектов или их частей, расположенных на территории Республики Саха (Якутия);
5) резервирование источников питьевого водоснабжения;
Пункт 6 исключен - постановление Правительства РСЯ от 03.05.2010 N 210
7) участие в организации и осуществлении государственного мониторинга водных объектов в пределах своей компетенции;
8) осуществление мер по охране водных объектов, находящихся в собственности Республики Саха (Якутия);
Пункты 9-10 исключены - постановление Правительства РСЯ от 03.05.2010 N 210
11) администрирование платы за пользование водными объектами, находящимися в собственности Республики Саха (Якутия);
12) проведение в установленном законодательством Российской Федерации порядке конкурсов, аукционов и заключение государственных контрактов на выполнение работ по осуществлению переданных полномочий.
13) проведение мониторинга федерального законодательства и ревизии нормативных правовых актов Республики Саха (Якутия), связанных с деятельностью Департамента, на предмет соответствия федеральному законодательству и вновь принятым нормативным правовым актам;
14) осуществление антикоррупционной экспертизы ведомственных нормативных правовых актов Республики Саха (Якутия), связанных с полномочиями Департамента.
(пункты 13 и 14 дополнены постановлением Правительства РСЯ от 08.02.2010 N 48)
4.2. Осуществляемыми за счет субвенций из федерального бюджета:
1) предоставление водных объектов или их частей, находящихся в федеральной собственности и расположенных на территории Республики Саха (Якутия), в пользование на основании договоров водопользования, решений о предоставлении водных объектов в пользование, за исключением случаев, указанных в части 1 статьи 21 Водного кодекса Российской Федерации;
2) осуществление мер по охране водных объектов или их частей, находящихся в федеральной собственности и расположенных на территории Республики Саха (Якутия);
3) подготовка и осуществление в установленном порядке противопаводковых мероприятий и пропуск паводковых вод на водных объектах, находящихся в федеральной собственности и полностью расположенных на территории Республики Саха (Якутия);
4) проверка готовности к пропуску паводковых вод водохозяйственных объектов, складов ГСМ, токсичных веществ, химических удобрений и ядохимикатов, накопителей сточных вод, источников загрязнения, расположенных в водоохранных зонах;
5) проверка наличия необходимых материалов, техники, оборудования и автотранспорта для оперативной ликвидации чрезвычайных ситуаций, связанных с прохождением половодья и паводков.