Департамент несет ответственность за:
9.1. Эффективную реализацию государственной политики Республики Саха (Якутия) в области водных отношений.
9.2. Своевременное и качественное исполнение республиканских целевых программ в области охраны и использования водных ресурсов, водоохранных мероприятий.
9.3. Качественную реализацию полномочий Департамента и соответствие ее законодательству Российской Федерации и Республики Саха (Якутия).
9.4. Оздоровление и улучшение качества воды на всей территории Республики Саха (Якутия).
9.5. Своевременное предупреждение, выявление и пресечение нарушений в сфере охраны водной среды и водопользования.
9.6. Эффективное и целевое использование выделенных бюджетных средств.
9.7. Достоверность и своевременное представление установленной отчетности.
9.8. Правильность и юридическую законность осуществляемых Департаментом действий.
9.9. Соблюдение установленных правил работы с документами.
9.10. Соблюдение законодательства о государственной гражданской службе.
9.11. Соблюдение работниками Департамента трудовой дисциплины и распорядка рабочего дня.