Общий контроль за реализацией программы осуществляет государственный заказчик программы - управление сельского хозяйства правительства области.
Ежеквартально государственный заказчик программы представляет в управление экономики правительства области отчет о ходе реализации программы.
Ежегодно правительству области представляется отчет о результатах реализации программы и эффективности использования бюджетных средств.