3.1. Министерство возглавляет Министр образования и науки, назначаемый и освобождаемый от должности Председателем Правительства Республики Хакасия.
Министр несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство задач и осуществление им своих функций.
3.2. Структура Министерства определяется в соответствии с его полномочиями и утверждается Председателем Правительства Республики Хакасия.
3.3. В целях реализации полномочий Министерства Министр:
руководит на принципах единоначалия деятельностью Министерства, без доверенности представляет Министерство в отношениях с другими органами государственной власти, органами местного самоуправления, организациями и гражданами;
распределяет обязанности между заместителями Министра и руководителями структурных подразделений Министерства;
издает приказы и распоряжения Министерства;
дает поручения по вопросам работы Министерства, обязательные для государственных служащих и иных работников Министерства, а также подведомственных организаций;
представляет на утверждение Председателю Правительства Республики Хакасия предложения о предельной штатной численности и структуре Министерства;
утверждает положения о структурных подразделениях и штатное расписание Министерства;
назначает на должность и освобождает от должности государственных служащих, работающих в Министерстве, в установленном законодательством Российской Федерации порядке принимает на работу и увольняет иных работников Министерства;
назначает на должность и освобождает от должности руководителей подведомственных учреждений и организаций;
заключает трудовые договоры (контракты), решает вопросы, связанные с прохождением государственной службы в Министерстве, принимает решения о поощрении государственных служащих и других работников, работающих в Министерстве, и применении к ним мер дисциплинарного взыскания, обеспечивает проведение аттестации, профессиональную переподготовку и повышение квалификации государственных служащих, работающих в Министерстве;
утверждает положение о коллегии Министерства и ее состав;
утверждает бюджетные сметы Министерства;
осуществляет расходы Министерства в пределах бюджетной сметы;
осуществляет другие полномочия в соответствии с законодательством Российской Федерации и законодательством Республики Хакасия.
3.4. В Министерстве образуется коллегия Министерства, являющаяся совещательным органом, в составе Министра (председатель коллегии), его заместителей (по должности), а также других руководителей структурных подразделений Министерства. В состав коллегии Министерства могут включаться, по согласованию, представители федеральных органов исполнительной власти, органов законодательной и исполнительной власти Республики Хакасия, органов местного самоуправления, некоммерческих организаций, ученые и специалисты.
3.5. При Министерстве могут создаваться другие совещательные и консультативные органы, действующие на основании положений, утверждаемых Министром.