Текущее управление и непосредственный контроль за ходом реализации Программы осуществляется уполномоченным органом исполнительной власти Ненецкого автономного округа.
Корректировка Программы, в том числе включение в нее новых программных мероприятий, а также изменение сроков ее реализации осуществляется в установленном порядке по предложению государственного заказчика Программы.
Непосредственный контроль за ходом реализации Программы включает в себя представление исполнителями периодической отчетности о реализации программных мероприятий и рациональном использовании выделяемых им финансовых средств, качестве реализуемых программных мероприятий государственному заказчику Программы.
Контроль за исполнением Программы в соответствии с действующим законодательством осуществляют Администрация Ненецкого автономного округа, Собрание депутатов Ненецкого автономного округа и иные уполномоченные органы в пределах их компетенции.