Государственным заказчиком-разработчиком Программы является Министерство экономики Республики Бурятия.
Координация исполнения программных мероприятий, включая мониторинг их реализации, оценка результативности осуществляется Республиканским агентством по развитию промышленности, предпринимательства и инновационных технологий. РА по предпринимательству в целях реализации Программы привлекает на конкурсной основе муниципальные образования, организации инфраструктуры поддержки предпринимательства в Республике Бурятия.
РА по предпринимательству до 1 февраля года, следующего за отчетным, представляет в Координационный совет по совершенствованию форм и методов программно-целевого управления доклад о ходе реализации Республиканской целевой программы государственной поддержки и развития малого и среднего предпринимательства в Республике Бурятия на 2008-2012 годы.
В редакции Постановления Правительства Республики Бурятия от 19.07.2012 N 435