В рамках ФЦП "Модернизация транспортной системы России (2002 - 2010 годы)" и ФЦП "Экономическое и социальное развитие Дальнего Востока и Забайкалья до 2013 года" будет осуществляться модернизация всего комплекса международного аэропорта Улан-Удэ "Мухино" для повышения его конкурентоспособности, создание на его базе грузового терминала на маршруте Азия - Европа (как альтернативный "Великий шелковый путь").
Основным объектом реконструкции является удлинение и реконструкция взлетно-посадочной полосы, со строительством магистральной рулежной дорожки и расширением существующего перрона для приема всех типов воздушных судов. Развитие инфраструктуры аэропорта планируется осуществлять на принципах государственно-частного партнерства.
Предусматривается восстановление аэропорта в с. Горячинск, для возобновления полетов будет проведена реконструкция искусственной взлетно-посадочной полосы и строительство инфраструктуры для обслуживания пассажиров и обеспечения полетов.
Планируется строительство искусственной взлетно-посадочной полосы в п. Таксимо для обеспечения транспортных перевозок при освоении Северо-Байкальского производственно-инфраструктурного комплекса, в том числе при строительстве Мокской ГЭС.
В ОАО "Авиакомпания Бурятские авиалинии" будут проводиться работы по обновлению парка воздушных судов, в том числе по их получению в лизинг.