На территории Республики Алтай действуют Верховный Суд Республики Алтай, Арбитражный суд Республики Алтай, районные (городской) суды, мировые судьи, входящие в единую судебную систему Российской Федерации.
Создание и учреждение специальных судов и судебных должностей не допускается.
Для рассмотрения вопросов о соответствии законов, нормативных правовых актов органов государственной власти, органов местного самоуправления Конституции Российской Федерации и федеральным законам, Конституции Республики Алтай и законам Республики Алтай, а также для толкования Конституции Республики Алтай и республиканских законов может создаваться Конституционный суд Республики Алтай. Порядок его образования и деятельности, полномочия устанавливаются республиканским конституционным законом.