6.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Президентом Республики Саха (Якутия).
6.2. Министр имеет трех заместителей, в том числе одного первого заместителя, назначаемых на должность и освобождаемых от должности в порядке, установленном Президентом Республики Саха (Якутия).
6.3. Министр:
6.3.1. Руководит деятельностью Министерства.
6.3.2. Вносит в установленном порядке на рассмотрение Правительства Республики Саха (Якутия) проекты правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию Министерства.
6.3.3. Издает распоряжения и приказы, утверждает документы и нормативы, не требующие рассмотрения в Правительстве.
6.3.4. Устанавливает обязанности заместителей министра и руководителей структурных подразделений Министерства и утверждает должностные регламенты государственных служащих Министерства.
6.3.5. Утверждает структуру и штатное расписание аппарата Министерства в соответствии с нормативами, установленными Правительством Республики Саха (Якутия), а также Положением о структурных подразделениях Министерства, с учетом реализации нормативных актов Президента и Правительства Республики Саха (Якутия) относительно порядка формирования структуры органов исполнительной власти и соотношения категорий должностей государственных служащих.
6.3.6. Принимает и увольняет в соответствии с Трудовым кодексом Российской Федерации и законами о государственной гражданской службе Российской Федерации и Республики Саха (Якутия) государственных гражданских служащих и других работников в аппарат Министерства.
6.4. В Министерстве создается Коллегия в составе министра, его заместителей, руководителей предприятий, проектных организаций, финансирующих банков, органов снабжения, высококвалифицированных специалистов строительного и лесопромышленного комплексов и представителей других министерств и ведомств. Численность и персональный состав коллегии утверждаются Правительством Республики Саха (Якутия).
6.5. Для научного анализа проблем в области строительства, архитектуры и градостроительства, лесопромышленного комплекса в Министерстве образуются градостроительный, научно-технический и экономический советы. Персональный состав указанных советов и положения о них утверждаются министром.