Механизм реализации Программы базируется на принципах государственного протекционизма и социального партнерства в реализации мероприятий по социальному развитию села, четкого разграничения полномочий и ответственности всех участников Программы.
Реализация Программы предусматривает взаимодействие республиканских органов исполнительной власти - исполнителей и соисполнителей программных мероприятий, органов местного самоуправления, сельскохозяйственных и других организаций, осуществляющих свою хозяйственную деятельность в сельской местности, общественных организаций, а также сельского населения.
Основанием получения государственной поддержки на развитие социальной и инженерной инфраструктуры сельской местности являются:
бюджетная заявка органов исполнительной власти на реализацию инвестиционных мероприятий по республиканской целевой комплексной программе "Социальное развитие села до 2010 года";
ежегодное соглашение Правительства Карачаево-Черкесской Республики с Министерством сельского хозяйства Российской Федерации, предусматривающее взаимное обязательство по финансированию.