Механизм реализации Программы предусматривает применение широкого спектра экономических и организационных мер. Правовой основой механизма реализации Программы является федеральное законодательство, указы и распоряжения Президента Российской Федерации, постановления и распоряжения Правительства Российской Федерации, а также нормативные правовые акты автономного округа.
Формирование мероприятий Программы осуществляется исходя из национальных приоритетов в области здравоохранения, приоритетных задач социально-экономического развития автономного округа, концепции развития здравоохранения, с учетом предложений муниципальных образований.
Использование механизма реализации Программы базируется на сочетании региональных, муниципальных и отраслевых интересов при осуществлении государственной социальной политики с учетом возрастающей роли субъектов Российской Федерации в решении проблем социально-экономического развития.
Финансирование работ в рамках реализации программных мероприятий из окружного бюджета будет осуществляться целевым назначением через государственного заказчика - департамент здравоохранения, а при необходимости - в виде субсидий, направляемых в муниципальные образования на реализацию утвержденных мероприятий. (с изм. от 03.12.2007 г. N 106-ЗАО)
Распределение ассигнований по годам уточняется при составлении бюджетных заявок на очередной финансовый год с учётом хода выполнения мероприятий Программы. При необходимости заказчик вносит предложения о корректировке мероприятий, предусмотренных Программой, и сроков ее реализации.
Средства, выделяемые на выполнение мероприятий Программы в виде субсидий, направляются в муниципальные образования автономного округа в порядке, установленном нормативными правовыми актами автономного округа. Средства, предусмотренные для финансирования окружных учреждений и мероприятий, используются государственным заказчиком и ответственным за исполнение конкретного мероприятия. (с изм. от 03.12.2007 г. N 106-ЗАО)