В ТСЭМ Республики Саха (Якутия) к функциональным подсистемам относятся следующие элементы:
5.1. Абиотическая составляющая экосистем, включающая:
5.1.1. Мониторинг сейсмической опасности.
5.1.2. Мониторинг геокриологических систем.
5.1.3. Мониторинг загрязнения атмосферы.
5.1.4. Мониторинг загрязнения поверхностных вод.
5.1.5. Мониторинг загрязнения подземных вод.
5.1.6. Мониторинг других природных явлений: наводнений, ураганов, селей, пожаров.
5.2. Биотическая и биогенная составляющая экосистем, включающая:
5.2.1. Мониторинг состояния почвы.
5.2.2. Мониторинг растительного покрова.
5.2.3. Мониторинг состояния животного мира.
5.3. Здоровье человека и окружающей среды, включающая:
5.3.1. Мониторинг санитарно-эпидемиологической обстановки.