Для разрешения споров между Государственным Собранием Республики Марий Эл и Правительством Республики Марий Эл по вопросам осуществления их полномочий могут использоваться согласительные процедуры. В случае недостижения согласованного решения спор может быть передан на рассмотрение соответствующего суда.