Судьи Верховного Суда Республики Марий Эл назначаются Государственным Собранием Республики Марий Эл по представлению Президента Республики Марий Эл.
Председатель Верховного Суда Республики Марий Эл, заместители Председателя Верховного Суда Республики Марий Эл, председатели судебных коллегий Верховного Суда Республики Марий Эл назначаются Государственным Собранием Республики Марий Эл по представлению Президента Республики Марий Эл после предварительного рассмотрения этих кандидатур в Высшей квалификационной коллегии судей Российской Федерации.