Организационное обеспечение государственной системы лицензирования возлагается на государственный орган управления государственным фондом цедр.
Государственный орган управления фондом недр осуществляет подготовительную работу, связанную с проведением конкурсов (аукционов), выдачей лицензий, согласовывает условия лицензирования с государственными органами управления промышленностью, земельными, водными и лесными ресурсами, охраны окружающей природной среды, горного надзора, а в части, касающейся платы,-с государственными органами управления экономикой.
Лицензия выдается государственным органом управления фондом недр по согласованию с соответствующим органом представительной власти.
Положение о порядке лицензирования пользования недрами утверждается Правительством Республики Марий Эл.