Правительство Республики Марий Эл:
объединяет и направляет работу министерств, государственных комитетов Республики Марий Эл и других подведомственных ему органов и обеспечивает между ними необходимое взаимодействие;
образует, в случае необходимости, комитеты, управления и другие ведомства при Правительстве Республики Марий Эл, а также при министерствах Республики Марий Эл по делам экономического, хозяйственного и социально-культурного строительства, реорганизует и упраздняет эти органы;
утверждает положения о министерствах, государственных комитетах Республики Марий Эл, положения (уставы) о других подведомственных ему органах, а также устанавливает фонд оплаты труда на содержание их центральных аппаратов и вносит в них изменения;
назначает руководителей комитетов, управлений при министерствах, заместителей министров и председателей государственных комитетов Республики Марий Эл, заместителей руководителей других подведомственных ему органов, утверждает членов коллегий министерств и государственных комитетов Республики Марий Эл, других подчиненных ему органов, а также членов государственных комитетов Республики Марий Эл.