Правительство Республики Марий Эл непосредственно решает вопросы, входящие в его исключительные полномочия, другие-через соответствующие министерства, государственные комитеты и ведомства Республики Марий Эл и администрации районов и городов, сельсоветов, поселков, которые непосредственно несут ответственность за состояние и развитие отраслей, сфер управления и территорий.
Конкретные задачи и функции министерств, государственных комитетов и ведомств Республики Марий Эл и их ответственность определяются законами Республики Марий Эл, а также положениями, утверждаемыми Правительством Республики Марий Эл.
Правительство Республики Марий Эл непосредственно или через членов Правительства Республики Марий Эл может давать распоряжения по решению любых вопросов своей компетенции.