1. Управление и распоряжение средствами фонда осуществляется администрацией области, которая является областным государственным заказчиком на проведение работ по восстановлению и охране водных объектов.
2. На основании соглашения администрация области может передавать функции областного государственного заказчика на проведение работ по восстановлению и охране водных объектов специально уполномоченному органу управления использованием и охраной водного фонда Российской Федерации с передачей права распоряжения средствами фонда на период и в пределах полномочий, установленных соглашением и настоящим Законом.
Соглашением определяются права, обязанности и ответственность сторон по финансированию областной программы.
3. Расходование средств фонда на реализацию мероприятий по восстановлению и охране водных объектов осуществляется на конкурсной основе в соответствии с областной программой и сметами расходования средств фонда на текущий год.