Для оперативного управления Программой, привлечения внебюджетных источников финансирования и контроля эффективности выполняемых мероприятий при министерстве общего и профессионального образования области создан координационный совет и областной центр дополнительного образования одаренных детей и молодежи.
Министерство общего и профессионального образования области осуществляет контроль сроков выполнения мероприятий программы, целевого расходования выделяемых финансовых средств и эффективности их использования, ежегодно уточняет затраты по программным мероприятиям и состав исполнителей.