Департамент ветеринарии несет ответственность за:
эффективное и целевое использование выделенных бюджетных средств,
соблюдение лимитов численности и фонда оплаты труда работников аппарата, лимитов транспортных средств но Департаменту и подведомственным учреждениям,
достоверность и своевременное представление установленной отчетности,
своевременное составление и представление бюджетной росписи и лимитов бюджетных обязательств по подведомственным получателям и распорядителям бюджетных средств в орган, исполняющий бюджет,
соблюдение штатно-сметной дисциплины по аппарату Департамента и подведомственным учреждениям,
соответствие бюджетной росписи показателям, утвержденным Законом Республики Саха (Якутия) о бюджете