1. Главным распорядителем средств Фонда является Министерство финансов Республики Алтай.
2. Главный распорядитель средств Фонда на основании Реестра инвестиционных проектов, формируемого на конкурсной основе Министерством экономики Республики Алтай и утвержденного решением Инвестиционной комиссии Правительства Республики Алтай, в установленном порядке разрабатывает и выносит на утверждение Правительством Республики Алтай сводную смету доходов и расходов Фонда.
3. Контроль за формированием и целевым использованием средств Фонда осуществляет главный распорядитель средств Фонда.