По просьбе собственников документов негосударственной части Архивного фонда Республики Алтай архивные органы и учреждения Республики Алтай оказывают содействие в сохранении, комплектовании и использовании их архивов. Собственники документов негосударственной части Архивного фонда Республики Алтай имеют право на передачу их по соглашению на хранение в государственные архивы, создание страховых копий, реставрацию и использование.
Документы негосударственной части Архивного фонда Республики Алтай поступают в собственность государства и передаются на постоянное хранение в государственные архивы в случае ликвидации негосударственных объединений, учреждений, предприятий или смерти владельца при отсутствии правопреемников и законных наследников.