Природный парк является юридическим лицом в форме государственного учреждения, финансирование которого осуществляется за счет средств бюджета Сахалинской области, имеющим обособленное имущество, самостоятельный баланс, счета в органах казначейства и других кредитных организациях, печать с изображением герба Сахалинской области и со своим наименованием.
Государственное учреждение "Природный парк "Остров Монерон" находится в ведомственном подчинении агентства по туризму Сахалинской области.
(в ред. Постановлений Правительства Сахалинской области от 12.04.2010 N 155, от 13.05.2015 N 156, от 23.03.2016 N 123, от 14.06.2018 N 262, от 05.07.2019 N 285)