1. Министерство возглавляет Министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Главой Республики Алтай, Председателем Правительства Республики Алтай.
2. Министр несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство задач и реализацию государственной политики в установленной сфере деятельности.
3. Министр имеет заместителей Министра, назначаемых на должность и освобождаемых от должности приказом Министра по письменному согласованию с Главой Республики Алтай, Председателем Правительства Республики Алтай.
4. В Министерстве образуется коллегия в составе Министра (председатель коллегии), его заместителей, начальников отделов, а также других руководящих работников Министерства и иных лиц. Состав коллегии утверждается приказом Министра.
5. Министерство может образовывать научно-консультативные и экспертные советы.
6. Министр:
1) распределяет обязанности между своими заместителями по решению ими оперативных, организационных, организационно-штатных, кадровых, финансовых, производственно-хозяйственных и иных вопросов, относящихся к компетенции Министерства;
2) утверждает положения об отделах Министерства, подведомственных ему государственных учреждениях Республики Алтай;
3) назначает на должность и освобождает от должности работников Министерства;
4) назначает на должность и освобождает от должности руководителей подведомственных государственных учреждений;
5) утверждает структуру и штатное расписание Министерства, в пределах установленных Правительством Республики Алтай численности и фонда оплаты труда работников;
6) утверждает смету расходов на содержание работников Министерства и подведомственных ему государственных учреждений Республики Алтай в пределах ассигнований, предусмотренных в республиканском бюджете на соответствующий период и субвенций из федерального бюджета;
7) утверждает ежегодный план работы и показатели деятельности подведомственных Министерству государственных учреждений Республики Алтай, а также отчеты об их деятельности;
8) вносит Главе Республики Алтай, Председателю Правительства Республики Алтай и в Правительство Республики Алтай проекты нормативных правовых актов, другие документы по вопросам, относящимся к компетенции Министерства и подведомственных ему органов и организаций, а также предложения по реализации государственной политики в установленной сфере деятельности;
9) вносит в Министерство финансов Республики Алтай предложение по финансированию республиканского бюджета в части финансового обеспечения деятельности Министерства и подведомственных Министерству государственных учреждений Республики Алтай;
10) представляет в установленном порядке Министерство в отношениях с федеральными и республиканскими органами государственной власти, органами местного самоуправления;
11) решает в пределах своей компетенции вопросы о поощрении и привлечении к дисциплинарной ответственности работников Министерства, руководителей подведомственных Министерству государственных учреждений Республики Алтай;
12) осуществляет планирование деятельности Министерства;
13) издает правовые акты Министерства;
14) присваивает государственным гражданским служащим Министерства классные чины в порядке, установленном законодательством;
15) осуществляет иные полномочия в соответствии с законодательством.
7. Финансирование расходов на содержание Министерства осуществляется за счет средств, предусмотренных в республиканском бюджете и субвенций из федерального бюджета.
8. Министерство является юридическим лицом, имеет гербовую печать, иные печати, штампы, бланки установленного образца и счета, открываемые в управлении Федерального казначейства по Республике Алтай в соответствии с законодательством Российской Федерации.
9. Место нахождения Министерства: г.Горно-Алтайск.