Общий контроль за исполнением Программы осуществляется администрацией Магаданской области.
Механизм реализации Программы базируется на принципах партнерства территориальных органов федеральных органов исполнительной власти, органов исполнительной власти Магаданской области, а также четкого разграничения полномочий и ответственности всех исполнителей Программы. Решение задач по формированию и эффективному управлению реализацией Программы будет осуществляться путем обоснованного выбора форм и методов управления.