Наряду с позитивными изменениями существуют и проблемы развития малого и среднего предпринимательства в республике, которые обусловлены рядом причин:
территориальные диспропорции в уровне развития муниципальных образований региона;
неразвитость инфраструктуры поддержки и развития малого и среднего предпринимательства;
существует дисбаланс размещения информационных ресурсов, рынок информационных и консультационных услуг в стадии формирования.
остро стоит проблема качества продукции и продвижения ее на республиканский, российский и международный рынки.
высокая зависимость производства конечного продукта от завоза сырья и вспомогательных материалов.
высокий износ основных средств в сфере материального производства и агропромышленном комплексе. Коэффициент их обновления по отраслям местного производства в целом не превышает 4 процента;
дефицит квалифицированных кадров, недостаточный уровень профессиональной подготовки;
низкая активность органов местного самоуправления по развитию малого и среднего предпринимательства.
Тем не менее, потенциал для существенного увеличения количественных и качественных показателей деятельности малого и среднего предпринимательства в республике имеется. При условии реализации необходимого комплекса мер, направленных на поддержку и развитие малого и среднего бизнеса, возможно в течение ближайших 3 - 5 лет достижение уровня ведущих регионов в Дальневосточном федеральном округе.
Реализация государственной политики поддержки малого и среднего предпринимательства, основанной на программно-целевом подходе, при котором мероприятия взаимно увязаны по срокам, ресурсам и исполнителям, в сочетании с действенной системой управления и контроля создаст предпосылки для дальнейшего более динамичного развития этого сектора экономики.