Обучение по программам начального профессионального образования ведут 10 профессиональных училищ, 9 профлицеев, по программам среднего профессионального образования 11 государственных, 8 негосударственных и 2 филиала. В ведении Министерства образования Калининградской области находятся 3 учреждения среднего специального профессионального образования.
В учреждениях начального профессионального образования обучается 10,4 тыс. учащихся.
В учреждениях среднего специального профессионального образования - 12,4 тыс. студентов.
Систему высшего профессионального образования представляют более 40 учреждений высшего профессионального образования: 11 вузов, в том числе 5 негосударственных вузов, 25 филиалов вузов, в том числе 13 филиалов ведущих негосударственных вузов и 6 представительств государственных вузов.
Общая численность студентов в учреждениях высшего профессионального образования - 36,5 тыс. человек.
Областная сеть дополнительного образования представлена 75 учреждениями. Дополнительным образованием охвачены около 43,7% учащихся области. В среднем в спортивных секциях на базе школ занимается только каждый пятый учащийся, каждый десятый школьник занимается в спортивных школах и клубах. Обеспеченность спортивными залами составляет 87,7%.
В рамках повышения доступности для всех граждан реальных и равных возможностей получения качественного образования, расширения услуг, предоставляемых сетью дошкольных образовательных учреждений, в период с 2000 по 2006 годы открыты 132 группы кратковременного пребывания детей. К 2006 году удалось повысить охват детей дошкольного возраста образовательными услугами до 70,1%.
В 2006 году Калининградская область приняла участие в эксперименте по введению единого государственного экзамена. На территории области в нем приняли участие 8383 выпускника из 180 образовательных учреждений.