Морские порты являются основным звеном транспортной системы области. Морской порт Калининграда после утраты портов стран Балтии стал единственным незамерзающим портом России на Балтике и занимает 4% от российского рынка морских перевозок. Контейнерными линиями порт Калининграда связан с портами Голландии, Англии, Бельгии, Польши и стран Балтии. 12 стивидорных компаний на 17 километрах причальных линий порта предлагают свои услуги по перевалке грузов. Проектные возможности их терминалов позволяют перегружать до 20 миллионов тонн различных грузов в год. Это нефть и нефтепродукты, уголь, кокс, черные и цветные металлы, минеральные удобрения и др.
Преимуществом порта Балтийск является расположение его непосредственно у выхода в открытое море, что позволяет принимать крупнотоннажные суда.
Применительно к перспективам развития морских перевозок оказывается важным наличие развитой транспортной инфраструктуры, в том числе прохождение через область двух ответвлений трансъевропейских транспортных коридоров.
Преимущества портового комплекса области используются не в полной мере. Так, при проектных возможностях существующих портовых терминалов в Калининграде, Балтийске и Светлом в 20 млн. тонн грузов в год в 2005 году переработано 14,6 млн. тонн.
По мнению ряда российских экспертов, основными проблемами на ближайшем этапе развития калининградских портов являются:
1. Рост тарифов, прежде всего, на железнодорожный транспорт в странах Балтии - как фактор, существенно ограничивающий возможности развития портового комплекса Калининграда.
Рисунок 16. Индекс тарифов на грузоперевозки (в % 2005 г. по отношению к 2004 г.)
2. Малая глубина дна в Вислинском заливе, на берегу которого стоит Калининградский порт, существенно ограничивает возможности развития порта. Прохождение по морскому каналу занимает значительное время, а глубина диктует разрешенную судопроходимость. Ситуация требует создания на морском побережье глубоководного порта (с глубиной до 14 м), способного принимать суда с дедвейтом до 35 тонн и длиною до 200 м.
3. Порты, расположенные на Калининградском морском канале в пределах Калининграда, ограничены в дальнейшем развитии недостаточностью свободных территорий. Такая ситуация не позволяет осуществлять прием и обработку крупнотоннажных судов, что сдерживает рост объема переваливаемых грузов.
4. Грузовой транзит через макрорегион Балтики быстро расширяется, а нынешние возможности портов-конкурентов явно оказываются предпочтительными. Что диктует необходимость уточнения стратегии развития Калининградского портового комплекса и ее синхронизации с развитием С.-Петербурга в интересах российского присутствия на Балтике.