Воздушный транспорт является значимым звеном транспортной инфраструктуры Сахалинской области. Более 95% объема пассажирских перевозок за пределы области осуществляются воздушным транспортом, а внутри - осуществляется доставка пассажиров в труднодоступные местности, в том числе и на Курильские острова.
Федеральное государственное унитарное авиационное предприятие "Авиакомпания "Сахалинские Авиатрассы" является самой крупной авиакомпанией, базирующейся на Сахалине. Авиакомпания "Сахалинские Авиатрассы" намерена активно развивать чартерные авиаперевозки, которые являются одним из главных приоритетов среди направлений ее деятельности.
На территории области расположено 7 аэропортов, из которых 6 - областного значения. Выполняются регулярные пассажирские рейсы в города Японии и Республики Корея, увеличилось количество чартерных рейсов, осуществляемых российскими и зарубежными авиакомпаниями.