Приоритетные направления инновационной деятельности в Ростовской области задают общий вектор научно-технического развития региона и представляют следующие сферы реального сектора экономики, в которых применение новых технологий может принести значительный эффект:
в агропромышленном комплексе - внедрение новейших технологий возделывания сельскохозяйственных культур, разработка высокомеханизированных комплексов по производству, переработке и хранению сельскохозяйственной продукции, создание новых сортов сельскохозяйственных культур, технологии искусственного воспроизводства ценных видов рыб;
в минерально-сырьевом комплексе - разработка современных методов поиска, разведки и мониторинга запасов минерального сырья, повышение уровня их извлекаемости и переработки, создание новых систем глубокой переработки полезных ископаемых, обогащение и брикетирование углей, разработка высокоэффективных и экологически безопасных систем разведки нефтегазовых месторождений, добычи и транспортировки углеводородного сырья, новых технологий переработки и производства новых видов продукции;
в электроэнергетике - разработка парогазовых установок и газотурбинных надстроек паросиловых блоков для электростанций на газообразном топливе и высокоэффективных паросиловых энергоблоков с применением новейших технологий сжигания топлива для электростанций на твердом топливе, развитие экономически эффективной малой и нетрадиционной энергетики, разработка экологически чистого высококачественного энергоносителя, разработка экономически эффективных энергоустановок, использующих возобновляемые источники энергии, и повышении эффективности систем передачи электроэнергии на большие расстояния;
в инфокоммуникационных технологиях - развитие инфокоммуникационных технологий по созданию единого информационного пространства для обеспечения эффективной деятельности органов власти, бизнеса, бюджетной сферы и оказания социально значимых услуг населению Ростовской области;
в машиностроительном комплексе - разработка современных методов высокоточной обработки конструкционных материалов и повышения качества поверхностей деталей и металлоконструкций, механизации и автоматизации сборочных процессов, контроля и диагностики деталей и узлов в процессе изготовления и эксплуатации;
в строительстве и жилищно-коммунальное хозяйстве - разработка новых строительных технологий и материалов с заданными свойствами, строительство высокотехнологичных очистных сооружений, энерго- и теплосбережения, эффективное решение проблем утилизации отходов, использование и переработка вторичных ресурсов;
в химической и нефтехимической промышленности - разработка материало- и энергосберегающих технологий производства широкого спектра синтетических и композиционных материалов, в том числе новых поколений технологий экологически чистых базовых полимеров, химических волокон, синтетических каучуков, удобрений и ресурсосберегающих малотоннажных химических производств;
в здравоохранении - разработка биомедицинских технологий жизнеобеспечения и защиты человека, технологий создания лекарственных средств, технологий эффективной борьбы с факторами риска развития основных неинфекционных заболеваний, мониторинг и прогнозирование развития заболеваемости, смертности, технологий реализации возможностей телекоммуникационных систем для оказания лечебно-консультативной помощи специалистам отдаленных территорий Ростовской области;
в транспортном комплексе - модернизация транспортной инфраструктуры, повышение технического уровня всех видов транспорта, создание экологически чистого и высокоскоростного наземного транспорта.