Ежегодно в области отмечаются потери урожая от болезней. В 2004 году на яровых зерновых культурах они составили от 2 до 11%, на озимых зерновых культурах от снежной плесени потери урожая достигали 45%. Основным приёмом защиты зерновых культур от комплекса болезней является протравливание семян, основанное на результатах фитоэкспертизы семян с учётом действия применяемых препаратов на наиболее вредоносные патогены. В период вегетации на полях зерновых культур, с урожайностью выше 20 ц/га, экономически оправдана обработка посевов фунгицидами. Для защиты озимых культур от болезней выпревания необходимы осенние обработки фундазолом.