Министерство труда и социального развития Республики Алтай готовит бюджетные заявки на выделение ежегодных ассигнований для финансирования настоящей Программы из республиканского бюджета Республики Алтай и представляет их Министерству экономического развития и инвестиций Республики Алтай, а также предоставляет ему ежегодные отчеты об использовании выделенных средств. Информация о ходе выполнения мероприятий Программы заслушивается на заседаниях Республиканской межведомственной комиссии по охране труда, созданной постановлением Правительства Республики Алтай от 8 октября 2002 года N 279.
Контроль за целевым использованием финансовых средств осуществляет Министерство финансов Республики Алтай с участием Министерства экономического развития и инвестиций Республики Алтай.