Министерство на основании и во исполнение Конституции Российской Федерации, Конституции Республики Тыва, действующего законодательства самостоятельно осуществляет следующие функции:
4.1. содействие развитию науки и формированию механизмов государственной поддержки научно-технической и инновационной деятельности в агропромышленном комплексе, интеграции науки и образования, организации подготовки кадров;
4.2. содействие развитию взаимовыгодных экономических и научно-технических связей с зарубежными странами по вопросам агропромышленного комплекса;
4.3. обеспечение экономических условий для эффективного функционирования организаций любых форм собственности отрасли с целью достижения индикаторов оценки социально-экономического развития Республики Тыва;
4.4. осуществление правового регулирования в установленной сфере деятельности;
4.5. осуществление функций специально уполномоченного государственного органа по получению и распределению средств федерального бюджета на развитие агропромышленного комплекса республики и реализацию федеральных целевых программ;
4.6. сбор, анализ и обработка информации по производству сельхозпродукции в разрезе кожуунов и сумонов.