Заказчик-координатор Программы отвечает за реализацию Программы в целом, обеспечивает согласованные действия государственных заказчиков по подготовке и реализации программных мероприятий.
При необходимости государственный заказчик - координатор Программы вносит предложения о корректировке сроков реализации программных мероприятий. Ежегодно при подготовке бюджетной заявки на очередной финансовый год, с учетом хода выполнения мероприятий Программы, уточняются размеры государственной поддержки.
Контроль за выполнением Программы осуществляют Администрация Ненецкого автономного округа, Собрание депутатов Ненецкого автономного округа.