Органы государственного финансового контроля Республики Саха (Якутия) взаимодействуют с органами финансового контроля Российской Федерации, в том числе проводят совместные контрольные мероприятия, обмениваются результатами контрольной деятельности, методическими и нормативными материалами, создают ассоциации и другие объединения органов финансового контроля, проводят совместные научные и практические конференции, учебные семинары, курсы повышения квалификации.