Руководство (министр и его заместители)
Управление промышленности и инновационного развития
Отдел промышленности
Отдел научно-технического и инновационного развития
Управление топливно-энергетического комплекса и сводного экономического анализа
Отдел топливно-энергетического комплекса
Отдел сводного экономического анализа
Отдел транспорта и дорожного хозяйства
Отдел связи и телекоммуникационных систем
Отдел исключен - постановление Правительства Республики Дагестан от 31.07.2008 N 275, НГР:ru05000200800218)
Отдел финансово-хозяйственной деятельности и кадровой службы
Отдел организационной работы и делопроизводства".