Взаимодействие администрации округа с федеральными органами государственной власти, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти основывается на Конституции Российской Федерации и осуществляется в соответствии с федеральными конституционными законами, федеральными законами. Уставом Усть-Ордынского Бурятского автономного округа, законами округа, договорами о разграничении предметов ведения и полномочий с федеральными органами государственной власти и соглашениями о передаче осуществления части полномочий с федеральными органами исполнительной власти.