Механизм реализации Программы базируется на принципах социального партнерства федерального центра, регионов, муниципальных образований, хозяйственных и общественных организаций, всех слоев сельского населения, четкого разграничения полномочий и ответственности всех участников Программы.
Координатор Программы ежегодно уточняет и согласовывает перечень мероприятий о ходе реализации соответствующих разделов Программы и принимает меры по повышению эффективности ее реализации.
Реализация Программы предусматривает взаимодействие и участие органов государственной власти всех уровней, органов местного самоуправления, сельскохозяйственных и других организаций, осуществляющих хозяйственную деятельность в сельской местности, общественных организаций, а также сельского населения.
Основанием получения государственной поддержки за счет средств федерального бюджета на развитие социальной и инженерной инфраструктуры сельской местности является бюджетная заявка республики на реализацию инвестиционных мероприятий Программы, а также заключение ежегодных соглашений между Правительством Кабардино-Балкарской Республики и Министерством сельского хозяйства Российской Федерации, предусматривающих взаимные обязательства о финансировании программных мероприятий за счет долевого участия федерального бюджета, консолидированного бюджета Кабардино-Балкарской Республики и внебюджетных источников.