Управление реализацией Программы осуществляет Министерство сельского хозяйства Кабардино-Балкарской Республики, являющееся координатором Программы.
Министерство сельского хозяйства Кабардино-Балкарской Республики:
обеспечивает согласованные действия по подготовке и реализации программных мероприятий, целевому и эффективному использованию средств федерального, республиканского бюджетов и внебюджетных источников;
составляет и в установленном порядке представляет бюджетную заявку на ассигнования из федерального бюджета для финансирования Программы на очередной финансовый год;
подготавливает информационные справки и аналитические доклады о ходе реализации программных мероприятий;
осуществляет взаимодействие с республиканскими министерствами и ведомствами, являющимися исполнителями и соисполнителями мероприятий в рамках отдельных разделов Программы.
Управление разделом "Развитие сети автомобильных дорог в сельской местности" осуществляет Министерство транспорта и дорожного хозяйства Кабардино-Балкарской Республики совместно с Министерством сельского хозяйства Кабардино-Балкарской Республики на основе соглашения, управление разделом "Развитие телекоммуникационных сетей в сельской местности" - открытое акционерное общество "Каббалктелеком" совместно с Министерством сельского хозяйства Кабардино-Балкарской Республики на основе соглашения.
Государственный комитет Кабардино-Балкарской Республики по статистике совместно с координатором Программы организует ведение статистической отчетности по реализации Программы. Перечень показателей и периодичность отчетности согласовываются с Министерством экономического развития и торговли Кабардино-Балкарской Республики.
Координатор Программы с участием заинтересованных республиканских органов исполнительной власти и органов местного самоуправления подготавливает и до 1 марта каждого года представляет в Правительство Кабардино-Балкарской Республики доклад о ходе реализации Программы за прошедший год.
Контроль за ходом исполнения Программы осуществляет Парламент Кабардино-Балкарской Республики в соответствии с Законом Кабардино-Балкарской Республики "О государственных (целевых) программах социально-экономического развития Кабардино-Балкарской Республики".